В центре общественного внимания Нисифоров оказался, когдав ФСБ обратилась его бывшая секретарша, обвинившая своего шефа в сексуальных домогательствах.
В ноябре 2011 года было возбуждено уголовное дело по статьям «покушение на изнасилование» и «превышение должностных полномочий» по результатам проверки обращения 35-летней сотрудницы Генпрокуратуры, которая заявила, что Нисифоров попытался ее изнасиловать. Однако это обстоятельство не повлияло на карьеру высокопоставленного чиновника - после реорганизации в Генпрокуратуре Нисифоров продолжал возглавлять одно из управлений.
ДТП произошло 9 января 2012 года около 18:30 мск. Геннадия Нисифорова на пешеходном переходе на Нагатинской набережной в Москве сбил КАМАЗ, водитель которого не справился с управлением. По данным правоохранительных органов столицы, «Нисифоров был госпитализирован с тяжелой черепно-мозговой травмой в больницу» и скончался, - сообщает ИТАР-ТАСС.
Водитель грузовика - мужчина 1962 года рождения - задержан. По данному факту возбуждено уголовное дело (Нарушение правил дорожного движения и эксплуатации транспортных средств, повлекшее по неосторожности смерть человека). Проводится расследование.
Кубанский экс-милиционер получил срок за ДТП с пострадавшими 
Полицейского из Ставрополя будут судить за смертельное ДТП на Кубани 
Полицейского Кубани подозревают в совершении смертельного ДТП 
Расследование дела о ДТП с паломниками передано в кубанский Следком 
Найден виновный в ДТП, в котором погиб краснодарский прокурор